بعدما أدركت مؤسسة الفرقان للتراث الإسلامي أن مهارات فهرسة المخطوطات في طريقها إلى الانقراض، ارتأت أن تقيم دورات تدريبية خاصة في مجال الفهرسة تجتذب العلماء الشباب وخريجي الجامعات وأمناء المكتبات والقيّمين عليها الذين لم يتلقوا تدريباً نوعياً في التعامل مع المخطوطات. وتم حتى الآن تنظيم تسع دورات دولية في الفهرسة في مختلف أنحاء المعمورة.