بالتعاون مع كلية دار العلوم في جامعة القاهرة، نظمت مؤسسة الفرقان للتراث الإسلامي دورة تدريبية على تحقيق المخطوطات العربية والإسلامية، وهي أول دورة تدريبية من نوعها ضمن إطار أنشطة مؤسستنا.
كانت الغاية من هذه الدورة إعداد اطارات مؤهلين يستطيعون إحياء التراث الإسلامي على أساس علمي ومنهجي.
عقدت الدورة التدريبية في المدة من 28 فبراير حتى 28 مايو، 2008 وحضرها أكثر من 37 مشاركاً من العاملين في حقل التحقيق.
قام بالتدريس في هذه الدورة أساتذة بارزون في جميع فروع علوم المخطوطات من بينهم الأستاذ الدكتور عبد الستار الحلوجي، والأستاذ الدكتور أيمن فؤاد سيد، والأستاذ الدكتور حسن الشافعي، والأستاذ الدكتور عصام الشنتي، والأستاذ الدكتور عبد الحميد مدكور، والأستاذ الدكتور حسين نصار، وغيرهم من أساتذة.